پاکستان کی اعلیٰ بیوروکریسی پر غیر بنگالیوں کا غلبہ تھا۔ بیوروکریسی شروع سے ہی ناظم الدین کی وزارت کو ناپسند کرتی تھی اور ناظم الدین کو ایک کمزور منتظم سمجھتی تھی، جو ملک کو درپیش سیاسی، انتظامی اور آئینی کاموں کو پورا کرنے سے قاصر تھا۔ تاہم، ناظم الدین کی وزارت کی برطرفی کی فوری وجہ احمدیہ مخالف فسادات اور خوراک کی قلت تھی جس نے ناظم الدین حکومت کے لیے مشکلات پیدا کیں۔
سنہ195-52 کے دوران مناسب بارشوں کی کمی اور پھر سیلاب کی وجہ سے پنجاب اور سندھ میں فصلوں کو بری طرح نقصان پہنچا۔ مزید برآں، زمینی اصلاحات کے امکانات نے گندم کی پیداوار کو متاثر کیا اس لیے خوراک کی یہ قلت زمینداروں کی وجہ سے پیدا ہوئی جو دولتانہ حکومت کی طرف سے زراعت کے کرایہ داروں کے حق میں کی گئی معمولی اصلاحات کی وجہ سے مخالف ہو گئے تھے۔ اس پس منظر کے ساتھ، جب ناظم الدین نے احمدیوں کو غیر مسلم قرار دینے سے عاجزی کا اظہار کیا تو علماء نے براہ راست کارروائی شروع کی۔ مطالبات کے ساتھ پانچ رضاکاروں نے پلے کارڈز اٹھائے وزیر اعظم کی رہائش گاہ تک مارچ کیا اور صورتحال اس وقت خراب ہو گئی جب پنجاب کے وزیر اعلیٰ ممتاز دولتانہ نے مطالبات کی توثیق کی اور مرکز سے ان کی منظوری کی اپیل کی۔
لاہور میں امن و امان کی صورتحال کو برقرار رکھنے کے لیے ایوب خان نے مارشل لاء لگا دیا تھا جو فوج کے کمانڈر ان چیف تھے، براہ راست کارروائی کے بعد پیدا ہونے والی بد نظمی پر قابو پانے کے لیے۔ ممتاز دولتانہ نے نہ صرف اپنے پہلے والے بیان کو واپس لیا بلکہ فیروز خان نون کے لیے وزیر اعلیٰ کا عہدہ بھی خالی کر دیا۔ چند دنوں کے بعد پنجاب اسمبلی نے بجٹ پاس کر دیا اور سخت مالی حالات کی روشنی میں دفاعی بجٹ میں ایک تہائی کمی کی وجہ سے ناظم الدین کے لیے صورتحال مزید خراب ہو گئی۔ اس صورتحال نے نظام الدین حکومت کے لیے فوجی رہنماؤں کے درمیان ناراضگی پیدا کر دی۔ تاہم، ناظم الدین کو پھر بھی آئین ساز اسمبلی کا اعتماد حاصل تھا اور وہ اسمبلی میں اپنے مخالفین کو شکست دے سکتے تھے۔
تاہم، غلام محمد نے بیوروکریسی اور فوجی قیادت کے تعاون سے عبوری آئین کی طرف سے دیے گئے صوابدیدی اختیار کا استعمال کیا اور ناظم الدین کو برطرف کردیا۔ انہیں غلام محمد نے اپنی کابینہ کے ساتھ طلب کیا اور اس وقت مستعفی ہونے کا حکم دیا جب ناظم الدین نے اسے اپنی کابینہ سمیت برطرف کرنے سے انکار کر دیا۔ گورنر جنرل نے اپنائے گئے گورنمنٹ آف انڈیا ایکٹ کے سیکشن 10 کے تحت کام کیا تھا، اس طرح ناظم الدین بیوروکریٹک فوجی بغاوت کا شکار ہو گئے۔ ناظم الدین نے اپنی برطرفی کے خلاف مزاحمت کرنے کی کوشش کی کیونکہ انہیں مقننہ کا اعتماد حاصل تھا اور انہوں نے سال 1953-54 کا بجٹ بھی پاس کیا تھا۔ اس نے غلام محمد کو گورنر جنرل کے عہدے سے ہٹانے کے لیے انگلینڈ میں ملکہ سے بھی رابطہ کرنے کی کوشش کی لیکن مطلوبہ اثر پیدا کرنے میں ناکام رہے۔ محمد علی بوگرہ 17 اپریل 1953 کو ملک کے نئے وزیر اعظم بنے۔