بے نظیر بھٹو ایک جدید مسلم ریاست کی پہلی خاتون وزیر اعظم تھیں۔ اگرچہ انہیں اپنے والد کی پارٹی پی پی پی وراثت میں ملی تھی، لیکن وہ خاندانی سیاست سے فائدہ اٹھانے والی تھیں اور ووٹروں کے ایک بڑے حصے کا ان کے کرشماتی خاندان سے جذباتی رشتہ ایک ملی جلی سیاسی نعمت ثابت ہوا ہے اور اسے فتح تک پہنچایا ہے، پارٹی جیت گئی۔ 1988 کے انتخابات میں ایک بہت ہی تنگ اکثریت اور اس وجہ سے حکومت بنانے کے لیے ایم کیو ایم اور دیگر کئی جماعتوں کے ساتھ اتحاد میں شامل ہونے پر مجبور ہوا۔
بینظیر وزیر اعظم کے طور پر اپنی پوزیشن مضبوط کرنے کے لیے آٹھویں ترمیم کو منسوخ کرنا چاہتی تھیں لیکن جلد ہی اس کوشش کو ترک کر دیا۔ بے نظیر کو نہ صرف فوجی قوتوں کے سیاسی کردار، مرکزی اور صوبائی حکومتوں کے درمیان اختیارات کی تقسیم اور اسلام کے کردار کے پرانے مسائل کا سامنا کرنا پڑا بلکہ نئے مسائل کا بھی سامنا کرنا پڑا، جس میں بجٹ کا بڑا خسارہ اور بڑھتا ہوا نسلی تشدد بھی شامل ہے۔
ابتدائی طور پر 2 دسمبر کو بینظیر بھٹو نے ایم کیو ایم کے ساتھ مل کر مخلوط حکومت بنائی۔ اپنے اقتدار کو برقرار رکھنے اور اپنے پروگراموں کو عملی جامہ پہنانے کے لیے، بے نظیر کو ایک طاقتور صدر اور فوجی اشرافیہ کے درمیان کامیابی سے جوڑ توڑ اور ایم کیو ایم اور نواز شریف کے ساتھ سیاسی موافقت تک پہنچنے کی ضرورت تھی۔ اس کے بجائے، اس نے محاذ آرائی کا راستہ اختیار کیا، جس میں صوبائی اسمبلی میں نواز کو ہٹانے کی ناکام کوششیں بھی شامل تھیں۔ اس کے علاوہ، پی پی پی کی اپنے اتحادی شراکت داروں کے ساتھ اقتدار میں حصہ لینے میں ناکامی مزید بیگانگی کا باعث بنی، جس میں اکتوبر 1989 میں ایم کیو ایم کی حکومت سے علیحدگی بھی شامل ہے۔
بے نظیر نے سرد جنگ کی اہم دہائی کے دوران یہ عہدہ سنبھالا۔ اپنی پہلی حکومت کے دوران، بے نظیر بھٹو کی خارجہ پالیسی افغانستان، بھارت اور امریکہ کے گرد گھومتی تھی۔ مغربی محاذ پر، بے نظیر بھٹو نے کمزور کمیونسٹ حکومت اور خطے میں سوویت اثر و رسوخ کو گرانے کے لیے افغانستان میں مزید جارحانہ فوجی کارروائیوں کی بھی اجازت دی۔ وہ بھارت کے ساتھ دوستانہ تعلقات بھی چاہتی تھی۔ اپنی پہلی بار کے دوران، بے نظیر بھٹو نے ایٹم بم پروگرام میں ایک الگ لیکن مربوط جوہری ٹیسٹنگ پروگرام قائم کیا، اس طرح ایک نیوکلیئر ٹیسٹنگ پروگرام قائم کیا جہاں وزیر اعظم اور عسکری قیادت کو اجازت درکار تھی۔
بے نظیر بھٹو نے خفیہ پراجیکٹ انٹیگریٹڈ ریسرچ پروگرام (آئی آر پی) ایک میزائل پروگرام کا آغاز کیا اور اس کی نگرانی کی جو بے نظیر بھٹو کی نگرانی میں رہا اور 1996 میں کامیابی کے ساتھ ختم ہوا۔ بدر اول کے آغاز کے ساتھ ہی، پاکستان بینظیر بھٹو کی قیادت میں پہلا مسلم ملک بن گیا جس نے سیٹلائٹ کو زمین کے مدار میں لانچ کیا اور رکھا۔ انہوں نے ‘1990’ کو پاکستان میں خلا کا سال قرار دیا اور اس سیٹلائٹ کی تیاری میں حصہ لینے والے سائنسدانوں اور انجینئرز کو قومی اعزازات سے نوازا۔
مڈ نائٹ جیکال ایک سیاسی انٹیلی جنس آپریشن تھا جو صدر غلام اسحاق خان اور چیف آف آرمی سٹاف جنرل مرزا اسلم بیگ کی قیادت میں شروع کیا گیا تھا، جس کا مقصد بے نظیر کی پارٹی کے ارکان کو رشوت دے کر پارلیمنٹ میں عدم اعتماد کا ووٹ لانا تھا۔ نیم صدارتی نظام کی وجہ سے، بے نظیر کو نئی پالیسیاں مسلط کرنے کے لیے خان سے اجازت درکار تھی، جسے خان نے ویٹو کر دیا کیونکہ وہ اپنے نقطہ نظر کو معتدل یا متضاد سمجھتے تھے۔ بے نظیر نے اپنے قانون سازوں کے ذریعے نیم صدارتی نظام کو بدلنے کے لیے پارلیمانی جمہوریت کو منتقل کرنے کی بھی کوشش کی، لیکن خان کے آئینی اختیارات نے ہمیشہ بے نظیر کی کوششوں کو ویٹو کر دیا۔ اس نے وزیر اعظم اور صدر کے درمیان اقتدار کی کشمکش کو جنم دیا۔ بے روزگاری اور مزدوروں کی ہڑتالیں ہونے لگیں جس سے ملک کا معاشی پہیہ رک گیا اور جام ہو گیا اور بینظیر بھٹو صدر کے ساتھ سرد جنگ کی وجہ سے ان مسائل کو حل کرنے میں ناکام رہیں۔ نومبر 1990 میں، ایک طویل سیاسی جنگ کے بعد، خان نے بالآخر آٹھویں ترمیم کا استعمال کرتے ہوئے بدعنوانی، اقربا پروری اور استبداد کے الزامات کے بعد بے نظیر بھٹو کی حکومت کو برطرف کر دیا۔ خان نے جلد ہی 1990 میں نئے انتخابات کا مطالبہ کیا جہاں بھٹو نے اپنی شکست تسلیم کر لی۔